Lactobacillus spp ДНК

Днк бактерия в мазке расшифровка

общее количество бактерий

2015-09-11 09:16:41

Спрашивает Мария:

Здравствуйте ! Беспокоят обильные белые выделения и периодический зуд , сдала анализ на скрытые инфекции , при заборе анализа врач сказала что выделения очень обильные и есть сильное воспаление.

Результаты анализа : ДНК Gardnerella vaginalis1*109Не более ДНК Lactobacillus spp, ДНК Atopobium vaginae2*109Не более ДНК Lactobacillus spp, ДНК Lactobacillus spp.8*107Не менее ДНК Bacteria, ДНК Bacteria (общее количество бактерий)1*109Не менее 106. Коэффициент соотношения Lactobacillus spp. к Bacteria -1.

2 более “-1.0”. Все остальные инфекции не обнаружены . Что это значит ? Заранее большое спасибо за ответ .

14 сентября 2015 года

Отвечает Босяк Юлия Васильевна:

Здравствуйте, Мария! У Вас банальный бактериальный вагиноз, не более. Данное заболевание провоцирует обильные выделения, которые приводят к воспалительному процессу во влагалище. Обратитесь к гинекологу для назначения терапии.

2015-05-08 20:03:38

Спрашивает наталья:

Добрый вечер. Посмотрите, пожалуйста. . РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ мазка на ИППП — ДНК Gardnerella vaginalis 2×108 Копии/мл норма– Не более ДНК Lactobacillus spp ДНК Atopobium vaginae не обнаружено норма– Не более ДНК Lactobacillus spp ДНК Lactobacillus spp.

2×107 Копии/мл норма– Не менее ДНК Bacteria ДНК Bacteria(Общее количество бактерий) 6×108 Копии/мл норма– Не менее 106 Состояние бактериального микроценоза — Соотношения концентраций ДНК микроорганизмов соответствуют бактериальному вагинозу.Уреа,мико,хлам,трих,гонококк,кандида не обнаружена.

?Очень Вас прошу помогите. Благодарю ВАС. .

13 мая 2015 года

Отвечает Босяк Юлия Васильевна:

Здравствуйте, Наталья! Виртуально ни один врач назначать лечение не будет. Вам необходимо с результатом анализа обратиться к гинекологу. Ничего критичного у Вас нет, банальный бактериальный вагиноз. Жить открытой половой жизнью без лечения не рекомендую.

2014-10-09 12:40:16

Спрашивает Оксана:

Добрый день. Результаты анализов: ДНК Gardnerella vaginalis – 7*107 ДНК Lactobacillus spр. – 1*107 ДНК Bacteria (общее количество бактерий) – 3*107 ДНК Ureaplasma urealiticum – 5*106 ДНК Staphyloccus spp.- 2*103 ДНК Streptococcus spp.- 1*104 Нужно ли делать дополнительно посевы или можно сразу идти на приём к врачу, за назначением лечения?

09 октября 2014 года

Отвечает Дикая Надежда Ивановна:

Оксана, добрый день! Результат обследований – информативный, необходимо лечение. Пролечитесь, не жалейте денег, присутствует комбинорованая инфекция. Удачи Вам!

2014-06-27 07:13:58

Спрашивает Инга:

Добрый день! Помогите, пожалуйста, определиться с лечением.
Сдавала мазок на пцр, выявили:
уреаплазму уреалектикум в количестве 2*104 (референсное значение: не обнаружено) и микоплазму хоминис в количестве 5*106 (референсное значение: не обналужено). Так же был выявлен бактериальный вагиноз: количество лактобактерий – 1*105 (референсеое значение: не менее общего количества бактерий), общее количество бактерий – 3*108 (референсное значение: не менее 106), гарданелла вагиналис – 1*107 (референсное значение: не больше количества лактобактерий)
и атопобиум вагинале – 2*107 (референсное значение: не больше количества лактобактерий) У меня следующий вопрос. Если я сейчас начну лечить микоплазму с уреаплазмой антибиотиком, к примеру юнидоксом, вагиноз усугубится в разы, правильно? Как быть в таком случае?
И еще вопрос по поводу лечения вагиноза. Прочитала, что атопобиум вагинае практически не реагирует на метронидазол, которым обычно лечат бактериальный вагиноз и что именно он является причиной рецедивов данного заболевания. Что бы вы посоветовали для лечения? Может есть какой-то антибиотик влияющий сразу на все: и на уреаплазму с микоплазмой и на гарданеллу с атопобиумом?

17 сентября 2014 года

Отвечает Медицинский консультант портала «health-ua.org»:

Врач общей практики

Все ответы консультанта

Добрый день, Инга! Вы мыслите в верном направлении. Антибиотики Вам не нужны, даже противопоказаны. Дело в том, что Ваш основной диагноз – урогенитальный дисбактериоз. Именно потому, что нарушился баланс нормальной микрофлоры, на слизистых начала активно размножаться условнопатогенная и транзиторная микрофлора (уреаплазма, микоплазма).

Вам нужно восстановить нормальную микрофлору (препараты лактобактерий, аутовакцины, бактериофаги и т.д.), тогда и уреаплазмы с микоплазмами исчезнут с Ваших слизистых оболочек.

Если проведете антибиотикотерапию, получите временное улучшение состояния, а затем дисбактериоз усугубится (так как еще больше убьете нормальную микрофлору) и неизвестно, что осядет на слизистых в следующий раз.

2014-03-07 15:59:00

Спрашивает мария:

здравствуйте!помогите расшифровать результаты исследования; днк bacteria-общее количество бактерий(копий/мл)6.7*105 днк lactobacillus spp.(копий/мл)4.6*104 (не менее концентрации днк bacteria днк gardnerella vaginalis(копий/мл)не обнаружено (не превышает концентрацию днк lactobacillus днк atopobium vaginae(копий/мл) не обнаружено(не превышает концентрацию днк lactobacillus заключение:снижение степени бактериальной обсемененности.

11 марта 2014 года

Отвечает Пурпура Роксолана Йосиповна:

По результату анализа патогенной микрофлоры не найдено, однако количество полезной микрофлоры (лактобактерий) понижено. Это может свидетельствовать о бисбактериозе влагалища.

2013-03-02 22:30:55

Спрашивает Александра:

Здравствуйте. У меня такой вопрос? Была на приеме у гинеколога, шейка матки и стенки влагалища сильно воспалены( длительное время мучают выделения, зуд) доктор взял мазок на инфекции: В мазке ДНК Ureaplasma parvum 2*105 ДНК Gardnerella vaginalis Не обнаружено ДНК Atopobium vaginae Не обнаружено ДНК Lactobacillus spp. 1*107 ДНК Bacteria (общее количество бактерий) 2*107 1 – Коэффициент соотношения Lactobacillus spp. к Bacteria -0,1 2 – Коэффициент соотношения Lactobacillus spp. к G.vaginalis и A.vaginae 7,1 Состояние бактериального микроценоза Дисбиоз не выявлен

Что означают эти анализы?? Большое ли кол-во уреаплазмы у меня в мазке?? Дальнейший ход моих действий?? Если нужно лечение, то какое?? Спасибо

21 марта 2013 года

Отвечает Консультант медицинской лаборатории «Синэво Украина»:

Добрый день, Александра. Уреаплазм многовато, однако, т.к. лактобактерий больше чем уреаплазм, дисбиоза пока нет, и со временем, возможно, лактобактерии их вытеснят. Уреаплазмы относятся к группе транзиторных микроорганизмов. Другими словами, они могут временно находиться в половых путях здоровой женщины, не вызывая никаких проблем. В таком случае никакого лечения не требуется. Если же они вызывают воспаление – уреаплазмоз, нужно проводить лечение этого воспалительного процесса. Наконец, если воспаления нет, но Вы планируете, беременность или смену полового партнера, то от уреаплазм стоит избавиться. Т.к. у вас все же есть воспаление, то лучше все же пройти курс лечения, который вам назначит ваш врач на очном приеме.

2013-01-14 15:36:15

Спрашивает Анна:

Помогите пожалуйста расшифровать результаты анализа. Планируем малыша. Параметр Результат Референсные значения Ед.Изм. Количество клеток в образце (параметр используется для клинической интерпретации) более 500 Более 500 – для женщин; более 50 – для мужчин ДНК Candida albicans/glabrata/crusei (количественное исследование) Готов . Количество ДНК Candida albicans 2*107 Не обнаружено Копии/мл Количество ДНК Candida glabrata Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл Количество ДНК Candida crusei Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК U.parvum/U.urealyticum (количественное исследование) Готов . Количество ДНК Ureaplasma parvum 4*106 Не обнаружено Копии/мл Количество ДНК Ureaplasma urealyticum Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл Бактериальный вагиноз Готов . ДНК Gardnerella vaginalis 3*108 Не более ДНК Lactobacillus spp Копии/мл ДНК Atopobium vaginae 1*107 Не более ДНК Lactobacillus spp Копии/мл ДНК Lactobacillus spp. 3*108 Не менее ДНК Bacteria Копии/мл ДНК Bacteria (общее количество бактерий) 7*108 Не менее 106 Копии/мл 1 – Коэффициент соотношения Lactobacillus spp. к Bacteria -0,3 Более ” – 1.0″ 2 – Коэффициент соотношения Lactobacillus spp. к G.vaginalis и A.vaginae 0,0 Более “1.0” Состояние бактериального микроценоза Мезоценоз Дисбиоз не выявлен

Исследование выполнил: Егорова Е.А.

21 января 2013 года

Отвечает Серпенинова Ирина Викторовна:

врач акушер – гинеколог

Все ответы консультанта

Мезоценоз – это состояние микрофлоры влагалища, при котором количество лактобактерий (Lactobacterium sp) несколько ниже количества других бактерий (Bacteria), а количество гарднерелл/анаэробных бактерий (Gardnerella/ Atopobium) повышено.Иногда восстановление нормально микрофлоры происходит самостоятельно,иногда требует назначения препаратов,содержащих лактобактерии.

2012-11-30 17:53:15

Спрашивает Ольга:

Добрый день! Можете помочь расшифровать результаты анализов. О чем начать беспокоится? Параметр Результат Референсные значения Ед.Изм. Количество клеток в образце (параметр используется для клинической интерпретации) более 500 Более 500 – для женщин; более 50 – для мужчин Урогенитальные инфекции у женщин Готов . ДНК Neisseria gonorrhoeae Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Chlamydia trachomatis Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Mycoplasma genitalium Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Trichomonas vaginalis Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Ureaplasma parvum Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Ureaplasma urealyticum 1*104 Не обнаружено Копии/мл ДНК Mycoplasma hominis 2*103 Не обнаружено Копии/мл ДНК Candida albicans Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Candida glabrata Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Candida krusei Не обнаружено Не обнаружено Копии/мл ДНК Gardnerella vaginalis 2*105 Не более ДНК Lactobacillus spp Копии/мл ДНК Atopobium vaginae 1*104 Не более ДНК Lactobacillus spp Копии/мл ДНК Lactobacillus spp. 2*107 Не менее ДНК Bacteria Копии/мл ДНК Bacteria (общее количество бактерий) 4*107 Не менее 106 Копии/мл 1 – Коэффициент соотношения Lactobacillus spp. к Bacteria -0,2 Более ” – 1.0″ 2 – Коэффициент соотношения Lactobacillus spp. к G.vaginalis и A.vaginae 2,2 Более “1.0” Состояние бактериального микроценоза Дисбиоз не выявлен Дисбиоз не выявлен

ДНК вируса простого герпеса I, II (HSV I/II), Цитомегаловируса (CMV) Готов .

06 февраля 2013 года

Отвечает Консультант медицинской лаборатории «Синэво Украина»:

Добрый день, Ольга. В принципе, повода для беспокойства нет. Дисбиоз влагалища не выявлен. Выявленны условно-патогенные микроорганизмы, как уреаплазма, микоплазма и гарднерелла, однако их количество меньше полезной микрофлоры, поэтому дисбиоза нет. Но если вы планируете смену партнера или беременность от них все же лучше избавиться заранее.

2012-04-27 10:28:25

Спрашивает марина:

Здравствуйте! недавно сдала анализы, получила результаты, а расшифровать не получается, помогите пожалуйста! ДНК Gardnerella vaginalis 6*10*6,9% OKБ ДНК Atopobium vaginae1*10*7 ,14 % OKБ ДНК Lactobacillus sp. 2*10*7 ,менее 1% OKБДНК Bacteria (общее количество бактерий) 7*10*7ДНК Ureaplasma urealyticum ДНК не выявленаДНК Mycoplasma hominis 4,8*10*4грибы рода Candida ДНК не выявленаРезультаты исследований:ДНК N.gonorrhoeae. ДНК выявленаДНК C.trachomatis ДНК выявлена. ДНК M.genitalium ДНК не выявленаОгромное спасибо!

24 мая 2012 года

Отвечает Консультант медицинской лаборатории «Синэво Украина»:

Добрый день, Марина. У Вас выявлены ДНК гонококков, хламидий, гарднерелл, микоплазм, Atopobium vaginae. А также лактобактерии – нормальная микрофлора влагалища. Так что Вам на очный прием к гинекологу для назначения курса лечения Вам и Вашему партнеру.

У Вас выявлены ДНК гонококков, хламидий, гарднерелл, микоплазм, Atopobium vaginae. А также лактобактерии – нормальная микрофлора влагалища. Так что Вам на очный прием к гинекологу для назначения курса лечения Вам и Вашему партнеру.

Читать дальше

Инфаркт начинается со… рта

Здоровье человека во многом зависит от гигиены рта. Люди, у которых во рту находится большое количество микробов, чаще страдают от инфарктов, причем риск возрастает не из-за какой-то определенной бактерии, а от повышенного количества бактерий разных типов в целом. К такому выводу пришли ученые из США.

Читать дальше

Миф о «ядовитых укусах» драконов развенчан

На протяжении многих лет зоологи были уверены, что гигантские ящерицы-вараны с острова Комодо, укусив жертву, заражают рану огромным количеством бактерий, вызывающих сепсис и смерть животного. Неожиданно выяснилось, что это всего лишь миф.

Читать дальше

Что общего между банкоматом и общественным туалетом

Британские исследователи из компании, которая производит специальные антибактериальные покрытия, решили установить, насколько верны представления жителей Соединенного Королевства о наиболее загрязненных болезнетворными бактериями местах и предметах.

Предварительный опрос показал, что британцы считают рассадниками всевозможной заразы общественные туалеты и уличные телефоны-автоматы.

В отношении туалетов подозрения полностью подтвердились, а далее, к своему огромному удивлению, ученые обнаружили, что на клавиатуре банкоматов «проживает» микробов ничуть не меньше чем на унитазах общественных уборных.

Читать дальше

Кишечный фермент защищает организм от бактерий

Одной из загадок медицины является то, каким образом стенки кишечника, через которые организм впитывает питательные вещества, не позволяют кишечным бактериям и токсинам попадать в кровяной поток и вызывать серьезные инфекционные заболевания. Группа американских ученых из больницы общего профиля штата Массачусетс разгадала эту загадку

Днк bacteria в мазке что это такое – Гинеколог

Вагинальная микрофлора (вагинальная флора) – микроорганизмы, которые населяют влагалище. Они являются частью общей человеческой флоры. Количество и тип определяет состояние здоровья женщины. В норме в мазке на микрофлору должны преобладать бактерии рода Лактобациллы (лактобактерии), защищающие от патогенных микроорганизмов.

Лактобактерии производят молочную кислоту, которая, как предполагается, препятствует развитию патогенных бактерий (золотистого стафилококка, кишечной палочки и др.

), но незначительное количество в результатах анализов их допустимо.

Также они вырабатывают перекись водорода (H 2O 2), обладающую широким противомикробным спектром действия, и различные бактериоцины, которые также убивают других бактерий, но имеют более узкое направленное действие.

Нормальная вагинальная микрофлора может отличаться у некоторых этичных групп. Несколько исследований показали, что у значительной части (7-33%) здоровых женщин (особенно чернокожих и испаноязычных) отсутствует значительное количество лактобактерий.

Их роль играют молочно-кислые бактерии из других родов, которые также способны выделять молочную кислоту.

Поэтому предполагается, что при установлении нормы в мазке у женщин акцент должен быть сделан на pH влагалищной среды, а не только на наличие молочной кислоты.

Во время осмотра женщины гинеколог берет биологический образец из половых органов с целью исследования микрофлоры и определения степени чистоты. Забор проводится со стенок влагалища, цервикального канала и уретры. Диагностическая процедура необходима для определения состава микрофлоры с целью исключения воспалительного процесса.

Биологический материал берется во время профилактического осмотра, а также при жалобах, таких как боль выше лобка, зуд и жжение половых органов, а также выделения, указывающие на воспалительный процесс.

Мазок на микрофлору: что необходимо знать каждой женщине?

Процедура забора биологического образца проходит безболезненно. Доктор вводит гинекологическое зеркало с центральным фиксатором, позволяющее расширить влагалище для осмотра поверхности шейки матки. Материал со стенки половых органов берется специальной щеточкой или ватным тампоном.

Перед походом к «женскому врачу» необходимо соблюдать определенные правила, повышающие достоверность и информативность анализа:

  • за 2-3 дня не вступать в интимные отношения;
  • запрещаются спринцевания;
  • принимать ванную накануне визита к врачу не рекомендуется;
  • при проведении гигиенических интимных процедур пользоваться специальным невысушивающим мылом;
  • в период менструации посещение гинеколога не рекомендуется, лучше всего сдавать этот анализ сразу после ее прекращения;
  • минимум 2-3 часа не опорожнять мочевой пузырь.

Если женщина принимает какие-либо препараты, она должна об этом сообщить лечащему врачу. Проведение терапии некоторыми препаратами (например, антибиотиками) может исказить результат исследования.

Норма влагалищной микрофлоры

У здоровой женщины в мазке определяется около 95% лактобактерий. Молочная кислота, синтезирующаяся этими микроорганизмами, поддерживает необходимую среду влагалища, тем самым обеспечивая защиту от преобладания патогенной флоры.

При снижении иммунитета (к примеру, во время беременности, гормонального сбоя, после перенесенных стрессов) количество лактобактерий снижается. Это влечет за собою ослабление женского организма, что чревато усилением предрасположенности к инфекционным заболеваниям половой сферы.

В норме, кроме лактобактерий, в мазке допускается присутствие гарднерелл и кандид в малом количестве. При снижении иммунитета патогенные микроорганизмы начинают быстро размножаться, подавляя «молочные» бактерии. Это приводит к нарушению кислотности, что чревато развитием дисбактериоза влагалища, а также гарденелезом и кандидозом.

Показатели анализа – как их расшифровать?

Бланк с результатом анализа выдается врачу или непосредственно самой женщине. К вашему вниманию общая информация, помогающая разобраться в лабораторном исследовании.

Табличные сведения не должны использоваться при самолечении! Неверная терапия может усугубить воспалительный процесс и привести к неблагоприятному исходу!

Таблица. Место взятия мазка.

Буква латинского алфавита Откуда взят мазок (лат) Перевод
V vagina влагалище
C cervix цервикальный канал
U uretra мочеиспускательный канал

К вашему вниманию еще одна таблица – расшифровка результата исследования (норма и отклонение).

Показатель (сокращенно) Показатель (полностью) V (норма) C(норма) U(норма) О чем может свидетельствовать превышение показателя
Le Лейкоциты 0-10 0-30 0-6 Воспаление
Эп (пл.эп) Эпителий 4-10 4-10 4-10 Воспаление
Слизь Слизь Умеренное кол-во Умеренное кол-во Нет Признак инфекции
Gn Гонококки Инфекционное заболевание — гонорея
Trich Трихомонады Инфекционное заболевание — трихомониаз
Chlam. tr Хламидии Инфекционное заболевание — хламидиоз
Ключ. клетки Ключевые клетки Воспаление (бактериальный вагиноз)
Cand Candida Инфекционное заболевание – кандидоз
Гр.(+) Грамположительные палочки + + + Если не обнаружены, то возможно нарушение микрофлоры
Гр.(-) Грамотрицательные палочки Появление расценивается, как дисбактериоз или возможное воспаление

Степень чистоты гинекологического мазка

В медицине общее состояние микрофлоры влагалища имеет определенную формулировку. Существует четыре степени чистоты гинекологического мазка, по которым можно определить наличие воспаления.

Первая степень чистоты. Лейкоциты – от 0 до 4-5, pH влагалища – кислая. Флора обильно заселена лактобактериями. Эпителий и слизь в умеренном количестве. Начальная степень чистоты бывает у девочек, не живущих половой жизнью и у здоровых женщин при отсутствии воспалительных заболеваний (в том числе хронических) половых органов.

Вторая степень чистоты. Лейкоциты – от 5 до 10, pH влагалища – кислая.

В микробиологической флоре присутствует кокковая инфекция или дрожжевые грибки (процентное соотношение нормальных и патологических микроорганизмов приблизительно одинаковое, или по-другому — смешанная флора). Плоский эпителий и слизь в умеренном количестве.

Вторая степень чистоты не является идеальной, однако применять лечения нет необходимости. Женщина становится уязвимой, поэтому ей следует повышать местный иммунитет, чтобы предотвратить развитие воспаления.

Третья степень чистоты вызывает тревогу и обеспокоенность, поскольку в мазке повышенное количество эпителиальных клеток и патогенной микрофлоры при практически полном отсутствии лактобактерий. pH влагалища – слабокислая или щелочная.

Третья степень чистоты влагалища считается плохим результатом, сигнализирующим о текущем воспалительном процессе. Женщине важно пройти серьезную терапию, чтобы скорее вылечиться и избежать осложнений.

Четвертая степень чистоты. Палочки Додерлейна (или лактобактерий) не обнаруживаются даже в единичных количествах, поэтому Реакция pH однозначно будет щелочной.

Флора полностью состоит из болезнетворных микроорганизмов, лейкоциты посчитать невозможно, так как они визуализируются на всем поле. Это крайняя степень, сигнализирующая об опасности.

Женщине необходимо, кроме лечения, пройти комплексное обследование, чтобы исключить опасные заболевания половых органов (к примеру, текущая онкология половых органов нередко «выдает» плохой результат анализа).

Таблица. Лабораторная оценка чистоты мазка.

Исследование мазка на микрофлору – это важная и быстрая диагностика, позволяющая на ранних стадиях выявить серьезную патологию.

Своевременное и правильное лечение позволит избавиться от заболевания, не допуская его перехода в хроническую стадию.

Молодым девушка и женщинам, планирующим стать мамой, следует уделить большое внимание репродуктивному здоровью, чтобы в будущем не столкнуться с проблемой зачатия или благополучного вынашивания беременности.

Диагностика бактериального вагиноза, ДНК количественно

Диагностика бактериального вагиноза, ДНК количественно

1380 руб.

Исследование, направленное на выявление генетического материала (ДНК) микроорганизмов Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, для диагностики бактериального вагиноза.

Синонимы русские

Бактериальный вагиноз, ДНК , количественный анализ.

Синонимы английские

Bacterial vaginosis, DNA , quantitative, qRT-PCR.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Единицы измерения

ГЭ/мл (геномных эквивалентов на миллилитр).

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Соскоб урогенитальный.

Общая информация об исследовании

Бактериальный вагиноз является патологическим процессом, возникающим преимущественно у женщин репродуктивного возраста и характеризующимся изменением состава и соотношения микрофлоры влагалища.

Он является частой причиной патологических выделений, может быть ассоциирован с развитием воспалительных заболеваний органов малого таза у женщин и усиливает риск заражения инфекциями, передающимися половым путем.

Развитие бактериального вагиноза также повышает риск развития патологий беременности: преждевременных родов, самопроизвольных абортов, низкого веса ребенка при рождении, развития послеродового эндометрита, вагинита. Следует отметить, что у 50 % женщин бактериальный вагиноз может иметь бессимптомное течение.

У здоровых женщин репродуктивного возраста общее количество микроорганизмов в вагинальном отделяемом составляет 107-109 КОЕ/мл (колониеобразующих единиц на миллилитр) и состоит из более чем 40 разнообразных видов. Преобладают палочки Додерляйна, лактобациллы (Lactobacillus spp.): L. crispatus, L.

jensenii, L. acidophilus, L. brevis. Они поддерживают постоянство биохимического состава и обладают защитной функцией. Лактобациллы обладают способностью перерабатывать гликоген в молочную кислоту, продуцировать пероксид водорода, что позволяет поддерживать постоянство рН влагалища, снижая кислотность.

При этом подавляется рост условно-патогенной микрофлоры. При бактериальном вагинозе отмечается дисбиоз, нарушение соотношения и увеличение роста условно-патогенных, факультативно-анаэробных, анаэробных бактерий и микоплазм.

К таким микроорганизмам относятся Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae, Prevotella spp., Mobiluncus spp., Ureaplasma spp. и ряд других.

Снижение количества лактобактерий и избыточный рост условно-патогенных микроорганизмов приводит к нарушениям, которые могут клинически проявиться воспалением стенок влагалища – вагинитом, сопровождающимся выраженным зудом, жжением, аномальными выделениями.

Наиболее часто при бактериальном вагинозе увеличивается количество микроорганизмов: Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae. Gardnerella vaginalis относится к условно-патогенной микрофлоре влагалища, является факультативным анаэробом.

Микроорганизмы выявляются у 95-99 % женщин с бактериальным вагинозом, в том числе при его рецидивирующем течении. Чрезмерное размножение гарднерелл приводит к вытеснению преобладающих во влагалище при норме Lactobacillus spp. и стимулирует избыточный рост анаэробных бактерий и микоплазм.

Риск развития гарднереллеза увеличивают вагинальные спринцевания, использование внутриматочных контрацептивов и спиралей, хламидийная или гонококковая инфекция и т.д. Бактерия Atopobium vaginae является грамположительной анаэробной палочкой, выявляющейся у 99-100 % пациентов с бактериальным вагинозом.

Она играет роль в развитии воспалительных заболеваний органов малого таза у женщин, часто обнаруживается при рецидивирующем бактериальном вагинозе.

Обнаружение данных микроорганизмов играет важную роль в своевременной диагностике бактериального вагиноза, в том числе при его бессимптомном течении, предотвращении развития осложнений, а также в назначении правильной патогенетической терапии.

Диагностика бактериального вагиноза основана на сочетании клинических проявлений и данных лабораторного обследования. В лабораторной диагностике является важным определение видового состава микрофлоры влагалища и определение соотношения микроорганизмов. При этом определяется количество бактерий Lactobacillus spp. и других микроорганизмов.

К современным методам диагностики относится метод полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (РТ-ПЦР). Это метод молекулярной диагностики, позволяющий выявлять генетический материал исследуемого возбудителя.

Он характеризуется высокими показателями диагностической чувствительности и специфичности, быстротой получения конечного результата. Особенностью метода является возможность выявлять ДНК (дезоксирибонуклеиновую кислоту) вируса даже при малом содержании её в исследуемом биологическом материале.

Метод основан на многократном увеличении числа копий специфичного для данного возбудителя участка ДНК. При этом производится количественная оценка ДНК Bacteria (общее количество бактерий), Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae с анализом соотношения концентраций этих микроорганизмов.

Метод применяется для диагностики бактериального вагиноза, в том числе при его бессимптомном течении, у женщин с патологиями беременности, с развитием воспалительных осложнений после беременности, а также при назначении и контроле проводимой терапии.

При оценке результатов РТ-ПЦР выявляются фрагменты ДНК как живых, так и разрушенных микроорганизмов, поэтому результат исследования будет оставаться положительным еще в течение некоторого времени, даже если лечение было подобрано правильно.

Для чего используется исследование?

  • Для количественного выявления ДНК возбудителей Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae.
  • Для определения соотношения количества ДНК возбудителей Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae.
  • Для диагностики этиологии бактериального вагиноза и его осложнений.
  • Для назначения патогенетической терапии бактериального вагиноза и для оценки контроля проводимого лечения.

Когда назначается исследование?

  • При клинических проявлениях бактериального вагиноза (патологические выделения из влагалища, зуд, жжение), а также при его бессимптомном течении.
  • При развитии осложнений бактериального вагиноза, патологии беременности: преждевременные роды, самопроизвольные аборты, низкий вес ребенка при рождении, развитие послеродового эндометрита, вагинита.
  • При назначении и контроле проводимой терапии бактериального вагиноза.

Что означают результаты?

Референсные значения

ДНК Bacteria: более или равно 106 ГЭ/мл.

ДНК Lactobacillus: не менее концентрации ДНК Bacteria.

ДНК Gardnerellavaginalis: не превышает концентрацию ДНК Lactobacillus.

ДНК Atopobiumvaginae: не превышает концентрацию ДНК Lactobacillus.

Результаты выдаются с заключением врача.

Причины повышения:

  • наличие ДНК микроорганизмов Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae;
  • бактериальный вагиноз, вызванный нарушением соотношения возбудителей Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae.

Причины понижения:

  • отсутствие бактериального вагиноза, вызванного нарушением соотношения возбудителей Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae.

Важные замечания

  • При оценке результатов РТ-ПЦР выявляются фрагменты ДНК как живых, так и разрушенных микроорганизмов, поэтому результат исследования будет оставаться положительным еще в течение некоторого времени, даже если лечение было подобрано правильно.

Также рекомендуется

Gardnerella vaginalis, ДНК Анализ микробиоценоза влагалища. 16 показателей, ДНК количественно Анализ микробиоценоза влагалища. 8 показателей, ДНК количественно Посев на Gardnerella vaginalis с определением титра и чувствительности к противомикробным препаратам Исследование микробиоценоза влагалища с определением чувствительности к антибиотикам

Кто назначает исследование?

Гинеколог, акушер-гинеколог, уролог, терапевт, врач общей практики.

Литература

Вагинальный атопобиумAtopobium vaginae

Что такое вагинальный атопобиум (Atopobium vaginae)
Когда встречается атопобиум
Почему важно определение атопобиума
Как диагностируется атопобиум
Как лечатся состояния,связанные с атопобиум
Мои публикации
Где можно получить еще информацию

Что такое вагинальный атопобиум

Атопобиум (Atopobium vaginae) принадлежит к семейству Coriobacteriaceae и представляет собой грамположительную анаэробную палочку,производящую в процессе своей деятельности различные органические кислоты (молочную,уксусную,муравьиную).Впервые был описан в 1999 Rodriguez и др.,обнаруживших его в вагинальном тампоне,взятом от здоровой женщины используя анализ 16S rRNA.

Когда встречается вагинальный атопобиум

В настоящее время с Atopobium vaginae связывают развитие бактериального вагиноза и воспалительных заболеваний малого таза.Окончательно патогенная роль вагинального атопобиума не установлена.Вагинальный атопобиум со значительной частотой встречается у женщин с бактериальным вагинозом и в настоящее время считается,что инфекция, вызванная Atopobium vaginae более специфична для бактериального вагиноза, чем инфекция, вызванная Gardnerella vaginalis. Большая частота рецидивов бактериального вагиноза у женщин, у которых обнаружен A .vaginae и G. vaginalis подтверждает, что Atopobium vaginae имеет большое значение в развитие бактериального вагиноза и его осложнений.

Почему важно определение атопобиума

Определение Atopobium vaginae важно по нескольким причинам:

Маркер бактериального вагиноза
Вагинальный атопобиум считается высокоспецифичным маркером (специфическим признаком) бактериального вагиноза и его обнаружение свидетельствует о наличии у женщины этого заболевания,что особенно важно для диагностики бессимптомной формы бактериального вагиноза.Если это предположение будет окончательно доказано,то для диагностики бактериального вагиноза будет достаточно определить наличие Atopobium vaginae не прибегая к таким методам диагностики,как критерии Амселя,баллы Нугента,
определение лактобациллярной степени,что удешевит и ускорит диагностику.
Воспалительные заболевания малого таза
Практически доказана роль вагинального атопобиума в развитии рецидивирующих форм бактериального вагиноза и воспалительных заболеваний малого таза.
Целенаправленное лечение позволит предотвратить рецидивы бактериального вагиноза и развитие осложнений
Устойчивость к нитроимидазолам
Особенностью A. vaginae является высокая устойчивость к метронидазолу — традиционному средству для лечения бактериального вагиноза.Обнаружение вагинального атопобиума позволяет избегать не эффективного лечения и во время назначить специфическое лечение
Возможная патогенность для мужчин
Изучается патогенность вагинального атопобиума у мужчин и рассматривается возможность временного или стойкого его носительства мужчинами,что важно в понимании
инфицирования вагинальным атопобиумом их половых партнеров.Возможно патогенная роль вагинального атопобиума в развитии анаэробных баланопоститов у мужчин.

Как диагностируется вагинальный атопобиум

Atopobium vaginae не имеет специфических микроскопических признаков как G.vaginalis и Mobiluncus spp. и выглядит под микроскопом как обычная коринобактерия,которые довольно часто встречаются у здоровых женщин.Также возникают трудности с его определением с помощью культурального исследования.Поэтому основным методом диагностики вагинального атопобиума является полимеразная цепная реакция.
С мая 2007 года Ростовским научно-исследовательским институтом Роспотребнадзора (web) проводится диагностика Atopobium vaginae методом ПЦР в рамках научно-исследовательской программы.

Как лечатся состояния,связанные с атопобиумом

Лечение состояний и заболеваний,связанных с вагинальным атопобиумом заключается в местном или в системном применении препаратов лекарственных групп,в зависимости от формы заболевания и некоторых других состояний и факторов.

Мои публикации

Частота выявления Atopobium vaginae и Gardnerella vaginalis методом полимеразной цепной реакции у сексуально-активных женщин
Агапов С.А., Водопьянов А.С., Олейников И.П., Водопьянов С.О.
РостНИПЧИ Роспотребнадзора, г. Ростов-на-Дону
Вагинальный атопобиум (Atopobium vaginae) в настоящее время считается одним из возбудителем бактериального вагиноза (7).Было отмечено более редкое обнаружение A.vaginae у женщин с нормальной микрофлорой,чем у женщин с бактериальным вагинозом (3,6) и у девственниц (1).Для детекции A.vaginae предложены ПЦР (2,4) и ПЦР real time (5).Однкао число публикаций и количество проведенных исследований пока невелико,чтобы сделать однозначные выводы о специфичности A.vaginae для диагностики бактериального вагиноза.Нами было проведено исследование целью которого было определить частоту выявления G.vaginalis и A.vaginae у сексуально-активных женщин с нормальной микрофлорой и у женщин с бактериальным вагинозом и возможности использования метода ПЦР как скрининговой реакции для диагностики бактериального вагиноза
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ: Определить частоту выявления у сексуально-активных женщин G.vaginalis и A.vaginae у женщин с нормальной микрофлорой и у женщин с бактериальным вагинозом.
МЕТОДЫ: Методом ПЦР исследовались вагинальные образцы,взятые от 136 женщин в возрасте от 17 до 45 лет,имеющих 2 и более половых партнеров в год.A.vaginae выявлен в 43 случаях (31.6 %),G.vaginalis в 89 (65,4 %) от общего числа исследуемых образцов.Бактериальный вагиноз был выявлен у 48 (35.2%) женщин.Наличие бактериального вагиноза оценивали по наличию 3 и более критериев Амселя.Частота вывления A.vaginae и G.vaginalis у женщин с бактериальным вагинозом составила соответственно 36 (75 %) и 48 (100%),а у женщин без бактериального вагиноза (n=88) A.vaginae выявлен в 7 (7,9%) случаев,а G.vaginalis в 41 (46,5 %) случаев.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Таким образом, Atopobium vaginae значительно чаще встречается у женщин с бактериальным вагинозом,чем у женщин с нормальной микрофлорой,что позволяет использовать его обнаружение с помощью ПЦР для скрининговой диагностики бактериального вагиноза.
Применение полимеразной цепной реакции для выявления колонизации A.vaginae уретры мужчин,половых партнеров женщин с бактериальным вагинозом.
Агапов С.А., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Олейников И.П.
РостНИПЧИ Роспотребнадзора, г. Ростов-на-Дону
Вагинальный атопобиум (Atopobium vaginae) в настоящее время считается одним из возбудителем бактериального вагиноза (7).A.vaginae обнаруживается у женщин с нормальной микрофлорой и бактериальным вагинозом (3,6),у девственниц (1) и у женщин постменструального периода (3).Для детекции A.vaginae предложены ПЦР (2,4) и ПЦР real time (5).Однако нам не встречались публикации о выявлении A.vaginae у мужчин и о возможной сексуальной трансмиссии микроорганизма.Нами было проведено исследование, целью которого было определить частоту выявления A.vaginae у мужчин — половых партнеров женщин с бактериальным вагинозом,у которых был выявлен вагинальный атопобиум.
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ: Определить частоту выявления Atopobium vaginae в уретре у мужчин — половых партнеров женщин с бактериальном вагинозом
МЕТОДЫ: Методом ПЦР исследовались уретральные образцы,взятые от 32 мужчин в возрасте от 22 до 47 лет,половых партнеров женщин с бактериальным вагинозом с выявленным A.vaginae.А.vaginae был выявлен в 15 (46.8%) случаев.При клиническом обследовании у 6 мужчин был выявлен баланопостит,другой патологии не было обнаружено.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ: A.vaginae колонизирует уретру мужчин,половых партнеров женщин с бактериальным вагинозом,что может свидетельствовать о сексуальной передаче микроорганизма.Наличие баланопоститов у мужчин может быть связано с инфицированием A.vaginae,хотя возможно в их формировании участвуют другие анаэробные бактерии — возбудители бактериального вагиноза (G.vaginalis,Mobiluncus sp.,Leptotrichia) что требует дальнейшего изучения.

Где можно получить еще информацию

Подбор статей и резюме статей по теме из PubMed (National Library of Medicine)

Избранное

посещений 120865 обновлено 11.07.10

На примере семейства глобиновых генов можно проследить, как случайные дупликации ДНК способствуют

10,5.2. Тандемно повторяющиеся последовательности ДНК стремятся остаться неизмененными

Дупликации генов обычно объясняют редкими событиями, которые катализируются некоторыми рекомбинационными ферментами.

Однако у высших эукариот имеется эффективная ферментативная система, которая соединяет концы разорванной молекулы ДНК. Таким образом, дупликации (а также инверсии, делеции и транслокации сегментов ДНК) могут возникать у этих организмов вследствие ошибочного воссоединения фрагментов хромосомы, которая по каким-то причинам оказалась разорванной. Если дуплицированные последовательности соединяются «голова к хвосту», то говорят о тандемных повторах. Появление одного тандемного повтора легко может привести к возникновению их длинной серии в результате неравного кроссинговера между двумя сестринскими хромосомами, поскольку длинные участки спаривающихся последовательностей представляют собой идеальный субстрат для обычной рекомбинации (рис. 10-63). Дупликация ДНК и следующий за ней неравный кроссинговер лежат в основе амплификации ДНК, процесса, который, как выяснилось, способствует возникновению раковых клеток (см. рис. 21-26). В ходе неравного кроссинговера число тандемно повторяющихся генов может как увеличиваться, так и уменьшаться (см. рис, 10-63). Большое количество повторяющихся генов будет поддерживаться естественным отбором лишь в том случае, если существование дополнительных копий окажется выгодным для организма. Как отмечалось выше, у позвоночных тандемный повтор кодирует большой предшественник рибосомной РНК, что необходимо для обеспечения потребности растущих клеток в новых рибосомах (см. разд. 9.4.16). Кластеры тандемно повторяющихся генов кодируют у позвоночных и другие структурные РНК, включая 5S-pPHK, U1- и U2-мяРНК. Тандемные повторы характерны и для гистоновых генов, на которых синтезируется большое количество белка, требующегося в каждой S-фазе.

Рис. 10-64. Два типа событий, позволяющих сохранить последовательности ДНК в тандемном расположении и очень похожими друг на друга. А. Постоянное увеличение и уменьшение числа копий гена в тандеме при неравном кроссинговере (см. рис. 10-63) приводит к гомогенизации всех последовательностей генов, входящих в состав кластера. Б. При конверсии генов одна копия действует как матрица, которая передает либо все.

либо часть последовательностей своей ДНК другой копии гена. У высших эукариот эти процессы, по-видимому, присущи генам, расположенным рядом друг с другом на хромосоме. У низших эукариот, например у грибов, конверсия генов у которых изучена гораздо лучше, этот процесс, как оказалось, не лимитирован лишь соседними генами.

Можно ожидать, что в ходе эволюции последовательности тандемно расположенных генов, а также нетранскрибируемой ДНК спенсеров, расположенных между ними, дивергируют за счет случайных мутаций. изменяющих одну или несколько копий гена. Однако на самом деле последовательности тандемно повторенных генов и их спейсерная ДНК обычно почти идентичны. Полагают, что к этому причастны два механизма:

во-первых, неравный кроссинговер, приводящий к последовательному расширению и сокращению областей, содержащих тандемно повторяющиеся последовательности (анализ компьютерной модели такого кроссинговера показывает, что при этом последовательности имеют тенденцию оставаться прежними, рис. 10-64, А); во-вторых, конверсия генов (показано, что она может обусловливать гомогенизацию родственных последовательностей ДНК, рис. 10-64, Б).

эволюции организмов

Дупликации ДНК имеют очень большое значение для эволюции новых белков. Чтобы убедиться в этом, обратимся к семейству глобиновых генов, поскольку его история изучена особенно хорошо. Явные гомологии в аминокислотной последовательности и в структуре современных глобиновых генов указывают на их происхождение от общего предка, несмотря на то, что некоторые члены этого семейства теперь расположены в геноме млекопитающих в совершенно разных местах.

Анализируя формы гемоглобина в организмах, стоящих на разных ступенях филогенетической лестницы, можно восстановить некоторые события, приведшие к возникновению разнообразных типов этого белка. Появление гемоглобиноподобных молекул в ходе эволюции, по-

видимому, способствовало увеличению размеров многоклеточных животных. Крупным животным для поддержания должного уровня кислорода в тканях уже недостаточно простой диффузии. В результате, гемоглобиновые молекулы обнаруживаются у всех позвоночных и многих беспозвоночных. Самая примитивная молекула, переносящая кислород, представляет собой глобиновую полипептидную цепь размером около 150

аминокислот. Она обнаруживается у многих морских червей, насекомых и примитивных рыб. Молекула гемоглобина у высших позвоночных устроена более сложно: в ее состав входит два типа глобиновых цепей. По-видимому, около 500 млн лет назад в ходе эволюции высших рыб произошла серия мутаций и дупликации соответствующего гена. В результате этих событий вначале образовалось два слегка отличающихся друг от друга гена, кодирующих цепи α- и β-глобинов в геноме каждой особи. У современных высших позвоночных каждая молекула гемоглобина представляет собой комплекс, состоящий из двух α- и двух β-цепей. (рис. 10-65). Такая структура функционирует гораздо более эффективно, чем молекула гемоглобина, содержащая одну цепь. Четыре кислород-связывающих сайта в молекуле α2β2 взаимодействуют друг с другом. Это взаимодействие приводит к кооперативному аллостерическому изменению в молекуле при связывании и освобождении кислорода, позволяющему доставлять в ткани гораздо большие порции кислорода.

В ходе дальнейшей эволюции млекопитающих мутации и дупликации, по-видимому, подвергся ген β-цепи, вследствие чего возник второй тип гемоглобина, синтезируемый только в эмбрионе. Образовавшаяся молекула гемоглобина обладает повышенным сродством к кислороду по сравнению с гемоглобином взрослой особи, и, таким образом, способствует переносу кислорода от матери к плоду. Ген, кодирующий

Рис. 10-65. Пространственная структура одноцепочечного и четырехцепочечного глобинов. Изображенный здесь четырехцепочечный гемоглобин представляет собой комплекс, состоящий из двух α- и двух β-глобиновых цепей. Глобин, состоящий из одной цепи, у некоторых примитивных позвоночных образует димер, который диссоциирует при связывании кислорода и представляет собой промежуточную ступень в эволюции глобина, содержащего четыре цепи.

Рис. 10-66. Схема эволюции цепей глобина на примере семейства β-подобиых глобиновых генов (см. рис. 10-39). Относительно недавно возникшие дупликации гена γ -цепи, привели к образованию γG- и γА-цепей, которые являются (3-подобными и обладают идентичными функциями.

Рис. 10-67. Структура молекулы антитела (иммуноглобулинов). Эта молекула состоит из двух идентичных тяжелых цепей и двух идентичных легких цепей (выделены цветом). Каждая тяжелая цепь содержит четыре сходных ковалентно связанных домена. Каждая легкая цепь имеет в своем составе два таких домена. Каждый домен кодируется отдельным экзоном; вероятно, все экзоны возникли в результате дупликации одного исходного экзона.

новую, похожую на β-цепь, молекулу гемоглобина, вновь подвергся последовательным мутациям и дупликациям, в ходе которых возникли два новых гена ε и γ. Цепь . синтезируется на более ранних стадиях развития (с образованием α2ε2), чем γ-цепь эмбриона, образующая форму α2γ2 (см.

рис. 10-39, Б). Дупликация гена β-цепи взрослых, происшедшая еще позже в ходе эволюции приматов, привела к образованию гена δ-глобина и соответственно минорной формы глобина (α2δ2), обнаруживаемой только у взрослых приматов (рис. 10-66). Каждый из этих дуплицировавшихся генов впоследствии был модифицирован за счет точковых мутаций, воздействующих на свойства конечной молекулы гемоглобина, а также в результате изменений в регуляторных областях, определяющих выбор времени и уровень экспрессии данного гена (см. рис. 10-73).

Конечный результат процесса дупликации генов, приведшего к дивергенции глобиновых цепей, хорошо виден при рассмотрении генов, возникших из исходного β-гена и расположенных в виде серии гомологичных последовательностей ДНК внутри сегмента ДНК размером 50000

нуклеотидных пар (см. рис. 10-39, А). У человека кластер α-глобиновых генов находится на другой хромосоме. На основании того, что у птиц и млекопитающих кластеры α- и β-глобиновых генов обнаруживаются в разных хромосомах, а у лягушки Xenopus они лежат рядом, считается, что два гена разъединились в результате транслокации примерно 300 млн лет назад (рис. 10-66). Подобные транслокации, вероятно, способствуют стабилизации дуплицированных генов, обладающих различными функциями, поскольку предохраняют их от гомогенизации, которой часто подвергаются близлежащие гены со сходной последовательностью (см. рис. 10-64).

Существует несколько дуплицированных последовательностей глобиновой ДНК, входящей в состав кластеров α- и β-глобиновых генов, которые не являются активными. Это пример псевдогенов, которые имеют высокую степень гомологии с активными генами, но неактивны вследствие мутаций, препятствующих их экспрессии. Существование подобных псевдогенов не должно вызывать удивления, ведь не все дупликации ДНК могут приводить к возникновению новых активных генов, между тем неактивные последовательности не удаляются из генома немедленно.

Сравнивая последовательности ДНК многих семейств генов у животных, стоящих на разных ступенях филогенеза, можно проследить значительную часть истории нашей эволюции (см. рис. 4-62).

10.5.4. Гены, кодирующие новые белки, могут образовываться при рекомбинации экзонов

Роль дупликации ДНК в эволюции не ограничивается их участием в образовании больших генных семейств. Дупликации могут иметь значение и для возникновения новых одиночных генов. Белки, кодируемые такими генами, можно узнать по присутствию в них повторяющихся сходных белковых доменов, которые последовательно ковалентно связаны друг с другом. Например, иммуноглобулины (рис. 10-67), альбумины, а также большинство фибриллярных белков (таких, как спектрины и коллагены) кодируются генами, возникшими в результате многократных дупликации исходной последовательности ДНК.

У генов, возникших таким путем, каждый экзон часто кодирует отдельную субъединицу или домен в белке (см. разд. 3.3.4). Организация кодирующих последовательностей ДНК в виде серии таких экзонов, разделенных длинными интронами, в значительной мере упростила эволюцию новых белков. Например, дупликации, необходимые для

образования отдельного гена, кодирующего белок с повторяющимися доменами, могут возникать при разрыве и воссоединении ДНК в любом месте длинных интронов, окружающих экзон. Без интронов в исходном гене было бы лишь несколько сайтов, рекомбинация по которым могла бы привести к дупликации домена. Увеличивая число возможных сайтов для дупликации, интроны значительно повышают вероятность того, что дупликация окажется полезной.

Наличие интронов намного увеличивает вероятность того, что случайная рекомбинация соединит две первоначально разделенные последовательности ДНК, которые кодируют различные домены белка (см, рис. 10-71). Результаты таких событий можно наблюдать во многих современных белках (см. рис. 3-38). Итак, большие расстояния между экзонами, кодирующими отдельные домены у высших эукариот, ускоряют процесс возникновения новых белков и, следовательно, увеличивают эффективность эволюции весьма сложных организмов.

10.5.5. Вероятно, большинство белков кодируются генами, состоящими из многих небольших экзонов

Открытие в 1977 г. прерывистости генов эукариот оказалось совершенно неожиданным. Все исследованные до этого гены были бактериального происхождения и не содержали интронов. У бактерий, как известно, отсутствуют ядро и внутренние мембраны, их геном меньше, чем геном эукариот, и традиционно считалось, что бактерия напоминает ту древнюю простую клетку, из которой произошла клетка эукариотическая. Неудивительно поэтому, что многие биологи вначале воспринимали интроны как причудливую позднейшую эволюционную добавку. Однако в настоящее время все больше утверждается точка зрения, согласно которой прерывистые гены имеют весьма древнее происхождение, а бактерии потеряли свои интроны лишь после того, как возникла большая часть их белков.

Мысль о том, что интроны появились в ходе эволюции очень давно соответствует современному представлению о происхождении белков методом проб и ошибок при рекомбинации отдельных экзонов, кодирующих различающиеся белковые домены. Более того, доказательства древнего происхождения интронов были получены при изучении генов, кодирующих распространенный фермент триозофосфатизомеразу.

Триозофосфатизомераза играет важную роль в метаболизме всех клеток, катализируя центральное событие при гликолизе и глюконеогенезе-

взаимопревращение глицералальдегида-3-фосфата и дигидроксиацетон-фосфата (см. рис. 2-38). Сравнивая аминокислотную последовательность этого фермента у различных организмов, можно сделать вывод, что фермент возник еще до дивергенции прокариот и эукариот от общего предка, поскольку 46% аминокислотной последовательности у человека и бактерии идентичны. У позвоночных (курицы и человека) ген, кодирующий этот фермент, содержит шесть интронов, причем пять из них присутствуют точно в том же месте у кукурузы. Из этого следует, что эти пять интронов существовали в гене до того, как растения и животные дивергировали в ходе эволюции эукариот, что, как установлено, произошло 109 лет назад (рис. 10-68).

Мелкие одноклеточные организмы находятся под сильным давлением отбора, что заставило их воспроизводиться путем деления клеток с максимальной скоростью, какую только позволяет содержание питательных веществ в окружающей среде. В связи с этим, они вынуждены свести к минимуму содержание ненужной ДНК, которую надо синтезировать в каждом цикле клеточного деления. Для организмов большего размера, живущих благодаря хищничеству, и в целом для многокле-

Рнс. 10-68. Эволюция прерывистых генов с древнейших времен. А. Структура гена триозофосфатизомеразы у растений и животных.

Одинаковые положения интронов у кукурузы (зерна) и позвоночных отмечены черными стрелками, а отличающиеся положения выделены красными стрелками. Так как считается, что растения и животные возникли от общего предка около миллиарда лет назад, общие интроны должны иметь очень древнее происхождение. Б, Гипотетическая схема возникновения определенного гена. Последовательности экзонов выделены цветом, а последовательности интрона обозначены черным. Приведенный здесь ген кодирует белок, необходимый для всех клеток. Подобно триозофосфатизомеразе, этот белок, по-видимому, сформировал свою окончательную трехмерную структуру перед тем, как от общего предка отделились бактерии, архебактерии и эукариоты. Этот общий предок обозначен на рисунке как «ген-прародитель». Пунктиром указано примерное время прохождения эндосимбиотических процессов, которые привели к возникновению митохондрий и хлоропластов. (А-по W. Gilbert, M.

Marchionni and G.Mc. Knight, Cell 46: 151-154, 1987.)

точных организмов, у которых скорости деления клеток определяются другими причинами, такое сильное давление отбора, ведущее к удалению избыточной ДНК из генома, отсутствует. Скорее всего именно эти обстоятельства объясняют, почему бактерии должны были потерять свои интроны, тогда как эукариоты их сохранили. Подобное объяснение соответствует также другим данным, полученным при изучении триозофосфатизомеразы: в то время как многоклеточный гриб Aspergillus содержит пять интронов в гене, кодирующем этот фермент, его одноклеточный родич, дрожжи Saccharomyces, не содержит их вообще.

Каков же механизм потери интронов? Возможно, интроны терялись при постепенных случайных делециях коротких сегментов ДНК, но более вероятно, что эукариотические клетки (а возможно, также и предки бактерий) имеют механизм точной и селективной делеции всего интрона из своих геномов. Например, в клетках большинства позвоночных содержится лишь один ген инсулина с двумя интронами, но у крыс no-соседству имеется еще один инсулиновый ген, в составе которого всего один интрон. Очевидно, второй ген возник относительно недавно в результате дупликации и затем потерял один из своих интронов. Так как при потере интрона необходимо точное воссоединение кодирующих последовательностей ДНК, считается, что второй ген возник в результате редкого события — включения в геном ДНК-копии мРНК соответствующего гена, откуда интроны были точно удалены. Подобные копии, не содержащие интронов, могут появляться благодаря активности обратных транскриптаз. Считают, что ферменты рекомбинации дают возможность таким копиям спариться с исходной последовательностью, которая затем «корректируется» по матрице, лишенной интронов, в ходе событий, напоминающих конверсию гена.

Обратные транскриптазы синтезируются в клетках транспозируемыми элементами (см. табл. 10-3) и всеми ретровирусами. Образование ДНК-копий частей генома при обратной транскрипции, по-видимому, тоже внесло свой вклад в эволюцию геномов высших организмов.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *